深层巩膜炎是巩膜基质的炎症，简称巩膜炎，较浅层巩膜炎少见，与浅层巩膜炎的区别在于浅层炎比较轻，结节边界比较清楚，不影响邻近组织（如角膜及色素膜）。深层巩膜炎以前部为多，在赤道部及后极部极少，炎症远较结节性巩膜浅层炎性猛而面广。

（一）病史基本同浅层巩膜炎。但自觉症状严重，并常发生反射性头痛。巩膜结节不如浅层的局限，颜色暗红、触痛明显，有的结节状炎变区扩张至角膜缘周围一圈，称为环状巩膜炎。
（二）前部的深层巩膜炎，常并发前葡萄膜炎。后部者则常并发脉络膜炎，伴发结膜水肿和眼球突出。炎症反复发生后，常致巩膜变薄呈暗紫色，有的可形成葡萄肿。
（三）多双眼发病，病程迁延，反复发作，易继发青光眼，影响视力，故预后严重不良。
（四）全身可进行免疫学实验室检查，进一步确定病因。

治疗原则
局部治疗基本上与浅层巩膜炎相同。但临床较多采用全身治疗措施。口服或静脉应用肾上腺皮质激素。对反复发作的顽固性病变，并可施行人工发热疗法。可配合应用免疫抑制剂治疗。并发前葡萄膜炎者，局部应用阿托品散瞳。